全球气温骤升，海平面急速上升，世界多处出现淹没区。R国，这一本就陆地资源紧张的岛国，更是岌岌可危。内阁重划区域，设立新政治经济中心在富士群山顶，取名新富士市。底层人民被禁止进入这个充满权力与财富的新城。而取代他们的新型生产力，是宫泽株式会社生产的冰冷机器。但作为宫泽株式会社的元老之一的萨多博士，却突然离开，重新创立了六本木AI研究所。传言他正在研究一种神秘的黑暗能量，没有人知道那将会带来什么后果。无数双眼睛凝视着未知，而他，却敞开了六本木的大门，任由人们参观。看似平常的六本木，却暗流涌动，怪事频频，游客也随之越来越少.....这里，究竟隐藏着多少秘密？做下自我介绍，我是各位的同事小乖，今天是例行开放参观日，请各位佩戴好工作证，让我们进入神秘的六本木。今天，也要好好完成博士的工作啊。